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Sébastien Vigneau

Sébastien Vigneau

41 ans
Permis : Vehicule B (Voiture)
Chercheur en génétique moléculaire et épigénétique
Chercheur post-doctoral à Philadelphie, potentiellement disponible pour une poste en Recherche/Développement
Poste recherché
Chercheur
Situation actuelle
En poste / En veille
Disponibilité
Plus de 6 mois

M. Sébastien Vigneau

Nationalité Française

Célibataire

41 ans

Né le 25/09/1979 à Toulouse

Aucun enfant

Expériences professionnelles

mars 2008 - aujourd’hui

Projet 1: Fonction de CTCF dans la mise en place d’une empreinte parentale dans l’ovocyte et l’embryon de souris. Projet 2: Contrôle épigénétique du gène MeCP2 dans le cerveau, C.D.D

Laboratoire de Marisa Bartolomei, Department of Cell and Developmental Biology, University of Pennsylvania School of Medecine, Philadelphia, USA

Chercheur post-doctoral

octobre 2003 - septembre 2007

étude fonctionnelle de l’inactivation du chromosome X au moyen de délétions ciblées dans le centre d’inactivation du chromosome X murin, C.D.D

Unité « Génétique Moléculaire Murine » dirigée par le Pr. Philip Avner, Institut Pasteur, Paris

Thèse de doctorat sous la direction du Dr Philippe Clerc

septembre 2002 - septembre 2003

Caractérisation de l’identité et de la migration des cellules exprimant le gène Dbx1 dans le télencéphale de souris, Stage

équipe « Régionalisation du cerveau » dirigée par le Dr. Marion Wassef, Ecole Normale Supérieure, Paris

Stage de DEA sous la direction du Dr Alessandra Pierani

Septembre 2009 - Décembre 2009

Projet de consulting

Penn Biotech Group, Philadelphia, USA

étude de marché pour un logiciel d’aide à la thérapie comportementale

Février 2009 - Mai 2009

Projet de consulting

Penn Biotech Group, Philadelphia, USA

étude de marché pour un logiciel d’analyse de puces à ADN

février 2002 - juin 2002

Caractérisation des éléments régulant l’expression du gène msxB chez le poisson zèbre, Stage

Équipe « Contrôle de l’identité neurale » dirigée par le Dr. Patrick Blader, Centre de Biologie du Développement, Toulouse

Stage de Maîtrise sous la direction du Dr Patrick Blader

juillet 2001 - septembre 2001

Mise au point d’un biocapteur enzymatique pour l’éthanol, Stage

Société Biosentec, Toulouse

février 2001 - juin 2001

Mise au point d’un système de complémentation fonctionnelle chez la légumineuse Medicago truncatula dans le but de réaliser le clonage positionnel du gène DMI1, Stage

Équipe « Signaux Symbiotiques » dirigée par le Dr Jean Dénarié, Institut National de Recherche Agronomique, Toulouse

Stage de Licence sous la direction du Dr Jean-Michel Ané

juillet 2000 - août 2000

Modélisation de potentiels évoqués visuels mesurés par électroencéphalogramme, Stage

Équipe de Margot Taylor, CerCo-CNRS, Toulouse

juillet 1998

Modélisation d’un élément de satellite par éléments finis, C.D.D

Alcatel Space, Toulouse

Enseignement et encadrement

Encadrement d’étudiants en stage au laboratoire Kristine Wong (février 2009 - aujourd’hui), Tuongvi Pham (2008 - aujourd’hui), Amy Campbell (mai 2008 - juin 2008)

Tutorage d’étudiants de niveau collège dans le cadre de projets scientifique avec l’association iPraxis (depuis juin 2008)

Animateur de groupe de discussion dans le cadre du Penn Reading Project (en 2008 et 2009)

Formation

2003-2007

Université Paris 6 - Pierre et Marie Curie

Doctorat, Étude fonctionnelle de l’inactivation du chromosome X au moyen de délétions ciblées dans le centre d’inactivation du chromosome X murin

Thèse dirigée par le Dr. Philippe Clerc, unité « Génétique Moléculaire Murine » dirigée par le Pr. Philip Avner, Institut Pasteur, Paris

2002-2003

Université Paris 6 - Pierre et Marie Curie

Master recherche, Biologie Moléculaire et Cellulaire du Développement, mention bien

2004-2007

Conservatoire National de Arts et Métiers

Certificate, bioinformatique, mention bien

Programmation en script shell, sql, html, scheme et java - Algorithmes et outils bioinformatiques

2002-2003

Université Toulouse 3 - Paul Sabatier

Master 1, Biologie Cellulaire et du Développement, mention bien

Congrès et ateliers

16-17 Mars 2009

Conférence « Emerging Evidence For Epigenomics Changes In Human Disease » Bethesda, Maryland, États-Unis

26-30 Juillet 2008

67ème congrès annuel de la Société de Biologie du Développement Philadelphie, Pennsylvanie, États-Unis

11-14 juin 2008

6ème congrès annuel de la Société Internationale pour la Recherche sur les Cellules Souches Philadelphie, Pennsylvanie, États-Unis

7-8 juin 2007

Journées Boris Ephrussi Forum des Cordeliers, Paris, France (présentation de poster)

4-9 septembre 2007

Conférence « Mouse Molecular Genetics » Hinxton, Cambridge, Angleterre (présentation de poster)

18-19 octobre 2006

Congrès annuel du département de biologie du développement de l’Institut Pasteur Institut Pasteur, Paris, France (communication orale)

17-19 septembre 2006

2nd International Conference on X-Chromosome Inactivation Paris, France (présentation de poster)

7-27 juin 2006

Cold Spring Harbor Laboratory Molecular Embryology of the Mouse Course Cold Spring Harbor, USA

5-8 mai 2006

EMBO Workshop « Functional Organization of the Cell Nucleus » Prague, Republique Tchèque (présentation de poster et communication orale)

24 février 2006

Conférence EuroSciCon « Visualizing transcription, gene positioning and reorganisation in the nucleus » UCL, Londres, Angleterre

4-8 janvier 2006

Conférence Jacques Monod « Epigenetics in Development and Disease : perspectives from multiple organisms » CNRS, Aussois, France (présentation de poster)

24-25 novembre 2005

Conférence « Genes regulation : from chromatin remodelling to transcription » Institut de Biologie Intégrative, Paris, France (présentation de poster)

18-19 janvier 2005

Congrès annuel du département de biologie du développement de l’Institut Pasteur Institut Pasteur, Paris, France (communication orale)

1-4 décembre 2003

Cours d’imagerie moléculaire et cellulaire dynamique Institut Jacques Monod, Paris, France

janvier 2003

Conférence ACI de « Biologie Intégrative » Collège de France, Paris, France (présentation de poster)

Publications

Genomic imprinting mechanisms in mammals. 2008

Ideraabdullah FY, Vigneau S, Bartolomei MS.
Mutat Res. 2008 Dec 1;647(1-2):77-85.

CTCF binding site classes exhibit distinct evolutionary, genomic, epigenomic and transcriptomic features. 2009

Essien K, Vigneau S, Apreleva S, Singh LN, Bartolomei MS, Hannenhalli S. (égale contribution des 3 premiers auteurs)
Genome Biol. 2009 Nov 18;10(11):R131

A role for non-coding Tsix transcription in partitioning chromatin domains within the mouse X-inactivation centre. 2009

Navarro P, Chantalat S, Foglio M, Chureau C, Vigneau S, Clerc P, Avner P, Rougeulle C.
Epigenetics Chromatin. 2009 Jul 20;2(1):8

H19 in the pouch. 2008

Bartolomei MS, Vigneau S, O’Neill MJ.
Nat Genet. 2008 Aug;40(8):932-3

Without Tsix, male X chromosome is inactivated. 2006

Vigneau S, Clerc P.
Med Sci (Paris). 2006 Nov;22(11):926-8.

An essential role for the DXPas34 tandem repeat and Tsix transcription in the counting process of X-chromosome inactivation. 2006

Vigneau S, Augui S, Navarro P, Avner P, Clerc P.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 May 9;103(19):7390-5.

Multiple origins of Cajal-Retzius cells at the borders of the developing pallium. 2006

Bielle F, Griveau A, Narboux-Nême N, Vigneau S, Sigrist M, Arber S, Wassef M, Pierani A.
Nat Neurosci. 2005 Aug;8(8):1002-12.

Financements

Bourse post-doctorale de la Fondation pour la Recherche Médicale mars 2008 - février 2009

Bourse doctorale de la Fondation pour la Recherche contre le Cancer Octobre 2006 - septembre 2007

Allocation de Recherche du Ministère de l’Enseignement Supérieur octobre 2003 - septembre 2006

Compétences en biologie

Génétique cellulaire et moléculaire Expert

clonage moléculaire, recombineering, culture et différentiation de cellules souches embryonnaires murines, génération et criblage de cellules recombinantes

Analyse transcriptionnelle et imagerie Expert

PCR quantitative en temps réel; immunoprécipitation de chromatine; tests alléliques; DNA-, RNA- et immuno-FISH; hybridation in situ et immunohistochimie in toto et sur coupes; microscopie à transmission, à epifluorescence et confocale; utilisation des logiciels Volocity et ImageJ

Embryologie Expert

Manipulation d’ovocytes et d’embryons de souris, culture organotypique de cerveau d’embryon, lignage cellulaire par marquage au DiI, initiation à un grand nombre de techniques lors du cours « Molecular Embryology of the Mouse » du Cold Spring Harbor Laboratory

Compétences en informatique

The Gimp Niveau avancé

Retouche d’images

Windows Vista Niveau avancé

Linux Niveau avancé

Mac OS Niveau avancé

R Débutant

Perl Débutant

Java Intermédiaire

Scheme Intermédiaire

HTML Intermédiaire

CSS Intermédiaire

Drupal Intermédiaire

Content Management Software

Wordpress Intermédiaire

Content Management Software

Open Atrium Niveau avancé

Groupware et gestion de projets

Dotproject Niveau avancé

Gestion de projet

SQL et PLSQL Intermédiaire

Base de données relationnelle

FileMaker Niveau avancé

Base de données relationnelle

Microsoft Access Débutant

Base de données relationnelle

Volocity Expert

Imagerie en microscopie

ImageJ Niveau avancé

Imagerie en microscopie

JaxCMS Niveau avancé

Gestion de colonies de souris

TeX and LaTeX Débutant

Traitement de texte

Suite Microsoft Office Niveau avancé

Suite bureautique

Open Office Niveau avancé

Suite bureautique

Adobe Illustrator Intermédiaire

Dessin vectoriel

Inkscape Niveau avancé

Dessin vectoriel

Adobe Photoshop Intermédiaire

Retouche d’image

GnuCash Niveau avancé

Comptabilité

Langues

Français Langue maternelle

Anglais Courant

Langue de travail et de communication habite aux États-Unis depuis mars 2008, obtention des diplômes DULAP et DULS de l’université Toulouse 3

Espagnol Courant

Obtention du diplôme DULS de l’université Toulouse 3

Portugais Débutant

Roumain Débutant

Japonais Débutant

Centres d’intérêt

Escalade

Danses lindy hop, tango argentin, salsa, forro...

Plongée Sous-Marine

Saxophone


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